Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a2P20490 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms