Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms