Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms