Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkceP16054 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkceP16054 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkceP16054 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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