Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calm3P0DP28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calm3P0DP28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calm3P0DP28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms