Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms