Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms