Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf6P0C6B7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms