Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr1P08046 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr1P08046 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr1P08046 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr1P08046 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Egr1P08046 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms