Protein–RNA interactions for Protein: P07321

Epo, Erythropoietin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpoP07321 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EpoP07321 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EpoP07321 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EpoP07321 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EpoP07321 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EpoP07321 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EpoP07321 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EpoP07321 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EpoP07321 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EpoP07321 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EpoP07321 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EpoP07321 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EpoP07321 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EpoP07321 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EpoP07321 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EpoP07321 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EpoP07321 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EpoP07321 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EpoP07321 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EpoP07321 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EpoP07321 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EpoP07321 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EpoP07321 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EpoP07321 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EpoP07321 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EpoP07321 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EpoP07321 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EpoP07321 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EpoP07321 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EpoP07321 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EpoP07321 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EpoP07321 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EpoP07321 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EpoP07321 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EpoP07321 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EpoP07321 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms