Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Got1P05201 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Got1P05201 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Got1P05201 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Got1P05201 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Got1P05201 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Got1P05201 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Got1P05201 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Got1P05201 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Got1P05201 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Got1P05201 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Got1P05201 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Got1P05201 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Got1P05201 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Got1P05201 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Got1P05201 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Got1P05201 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Got1P05201 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Got1P05201 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Got1P05201 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Got1P05201 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Got1P05201 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Got1P05201 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Got1P05201 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Got1P05201 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Got1P05201 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Got1P05201 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Got1P05201 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Got1P05201 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Got1P05201 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Got1P05201 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Got1P05201 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Got1P05201 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Got1P05201 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Got1P05201 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms