Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01735 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01735 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01735 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01735 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01735 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01735 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01735 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01735 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01735 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01735 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01735 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01735 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01735 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01735 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms