Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01635 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01635 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01635 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01635 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01635 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01635 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01635 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01635 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01635 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01635 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01635 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01635 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01635 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01635 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01635 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01635 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01635 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01635 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01635 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms