Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo1O89026 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Robo1O89026 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Robo1O89026 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms