Protein–RNA interactions for Protein: O89006

Magea1, Magea1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea1O89006 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Magea1O89006 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Magea1O89006 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Magea1O89006 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Magea1O89006 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Magea1O89006 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Magea1O89006 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Magea1O89006 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Magea1O89006 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Magea1O89006 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms