Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MscO88940 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MscO88940 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MscO88940 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MscO88940 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MscO88940 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MscO88940 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MscO88940 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MscO88940 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MscO88940 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MscO88940 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MscO88940 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MscO88940 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MscO88940 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MscO88940 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MscO88940 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MscO88940 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MscO88940 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MscO88940 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MscO88940 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MscO88940 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MscO88940 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MscO88940 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MscO88940 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MscO88940 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MscO88940 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MscO88940 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MscO88940 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MscO88940 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MscO88940 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MscO88940 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms