Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfrO88507 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfrO88507 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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