Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms