Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms