Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lnx1O70263 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lnx1O70263 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lnx1O70263 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lnx1O70263 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms