Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx4O55187 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms