Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap2O55126 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms