Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrxO55103 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrxO55103 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrxO55103 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrxO55103 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrxO55103 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrxO55103 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrxO55103 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrxO55103 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrxO55103 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrxO55103 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrxO55103 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PrxO55103 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PrxO55103 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrxO55103 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrxO55103 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrxO55103 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrxO55103 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrxO55103 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrxO55103 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrxO55103 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrxO55103 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrxO55103 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PrxO55103 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrxO55103 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrxO55103 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PrxO55103 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PrxO55103 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrxO55103 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrxO55103 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PrxO55103 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrxO55103 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PrxO55103 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PrxO55103 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrxO55103 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrxO55103 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrxO55103 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrxO55103 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrxO55103 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrxO55103 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrxO55103 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrxO55103 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PrxO55103 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms