Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnip3O55003 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms