Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NlkO54949 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NlkO54949 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NlkO54949 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NlkO54949 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NlkO54949 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NlkO54949 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NlkO54949 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NlkO54949 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NlkO54949 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms