Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CrxO54751 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CrxO54751 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CrxO54751 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CrxO54751 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CrxO54751 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CrxO54751 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CrxO54751 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CrxO54751 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CrxO54751 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CrxO54751 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CrxO54751 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms