Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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FxnO35943 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FxnO35943 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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FxnO35943 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FxnO35943 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FxnO35943 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FxnO35943 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FxnO35943 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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FxnO35943 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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FxnO35943 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FxnO35943 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FxnO35943 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FxnO35943 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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FxnO35943 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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FxnO35943 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FxnO35943 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FxnO35943 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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FxnO35943 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FxnO35943 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms