Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edil3O35474 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edil3O35474 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Edil3O35474 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edil3O35474 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edil3O35474 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms