Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf5O35445 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms