Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pkd2O35245 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms