Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebi3O35228 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebi3O35228 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebi3O35228 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebi3O35228 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebi3O35228 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ebi3O35228 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ebi3O35228 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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