Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms