Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm933J3QPC1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm933J3QPC1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms