Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc180J3QNE4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc180J3QNE4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms