Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms