Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930544D05RikJ3QK56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms