Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21060J3KMU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms