Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21719J3KMI9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm21719J3KMI9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm21719J3KMI9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21719J3KMI9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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