Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQF6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQF6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQF6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQF6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQF6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQF6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQF6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQF6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQF6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQF6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQF6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQF6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BQF6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BQF6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BQF6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQF6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQF6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms