Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm29394H3BIW7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm29394H3BIW7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms