Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubgcp6G5E8P0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms