Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34aG3UW52 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms