Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NpcdF8VQB8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms