Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp708F8VPP0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp708F8VPP0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms