Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms