Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms