Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms