Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930451I11RikE9Q9R3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms