Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700113H08RikE9Q9Q5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms