Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc146E9Q9F7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms